Responsabili Scientifici: COMAR MANOLA,  IEBBA VALERIO

Breve descrizione dell'attività formativa residenziale nel suo complesso
Attualmente si parla di introdurre il sequenziamento di nuova generazione (NGS), e più compiutamente lo shotgun sequencing, nella pratica clinica, in previsione di effettuare un approccio di medicina personalizzata e di precisione. Questo metodo prevede l'esame del paziente sotto un punto di vista "omico", globale, che deve avvalersi di database già presenti, ma che, comunque, devono arricchirsi con nuovi campioni forniti in ambito clinico. Assieme alle diverse tecniche di analisi omica, come ad esempio l'analisi del microbiota intestinale (metagenomica) o delle sue funzioni (metatrascrittomica, metabolomica), sono recentemente sorti nuovi algoritmi utili a ricostruire bioinformaticamente interi genomi batterici, chiamati metagenome-assembled genomes (MAGs). L'utilizzo di questi algoritmi, unito alla analisi delle reti sociali, può così condurre i ricercatori alla formulazione di specifici consorzi di specie batteriche, le quali, una volta selezionate, potranno essere direttamente coltivate secondo l'innovativo approccio della "culturomica", e successivamente caratterizzate per il loro potenziale teranostico.

Breve descrizione delle relazioni più significative
L'attività svolta da specialisti del settore è rivolta ad un ampio numero di professionisti sanitari che includono non solo personale dedicato alla ricerca ma anche a professionisti medici che svolgono attività clinico-assistenziale. L'introduzione di tecnologie altamente performanti in campo metagenomico sono in grado di fornire importanti opportunità di risoluzione di quesiti clinici che le attuali tecnologie non sono in grado di risolvere. In modo particolare, in ambito microbiologico, la possibilità di studiare le interazioni batteriche e il loro legame con patologie umane quali il cancro potrebbero attivare percorsi di stili di vita atti a definire percorsi di prevenzione o di allert sul possibile sviluppo oncogenetico.